V CZ většina psů s průkazem původu je vedena mezinárodní kynologickou organizací - FCI, jejíž rodokmeny vydává střešní CZ národní organizace ČMKU.

V CZ existuje i další  - málo známá organizace, která vydává průkazy původu odchovům zaregsitrovaným v jejich plemenných knihách - UCI.

Chovné podmínky u obou organizací jsou rozdílné.

Psi s průkazem původu vydaným FCI mají volný přístup na všechny kynologické akce pořádané FCI a mohou být jejich potomci dále zapisováni v jejich plemenných knihách. FCI průkazy původu uznávají také další  kynologické národní a nadnárodní (KC, AKC) organizace. Psi s průkazem původu FCI mohou se účastnit i akcí pořádaných UCI a působit v UCI chovech.

Psi s průkazem původu vydaným UCI se nemohou účastnít naproti tomu akcí pořádaných FCI, ani dále působit jako chovní jedinci v jejich plemenných knihách. Průkazy původu vydané UCI nejsou akceptovány většinou národních a nadnárodních (KC, AKC) organizací.

Chovné podmínky stanovené pro vydání PP FCI.

Pes i fena použiti k reproducki musí být starší 15 měsíců.
Fena nesmí překročit věk dovršeného 8 roku v době posledního krytí (pokud není povolena výjimka).

Pes i fena musí

úspěšně absolvování bonitace, po dosažení 12 měsíců věku
ohodnocení na výstavě pes nejhůře velmi dobrý, fena nejhůře dobrá
Vylučující vady:
fonatnela
jablkovitý tvar halvy (tj. nosní parite nedosahuje 1/3 celkové délky hlavy)
modré nebo dravčí oko
předkus nebo podkus
ucho přiložené těsně k hlavě
silně klenutý hřbet a bedra
lysivost kdekoli na těle
ztráta více než 4 zubů (mimo P1 a M3), ztráta dvou a více řezáků
chybí znaky pálení na hlavě u jedinců s pálením
rozsáhlý bílý znak na hrudi (nad 2cm²) a bílé znaky na končetinách
rozsáhlá černá prokvetlost tlumící základní barvu u červené s pálením
extrémní bázlivost
agresivita
kohoutková výška pod 18 cm

Po splnění chovných podmínek chov pražského krysaříka legislativně zastřešuje chovatelský klub (KPPPK - Klup přátel psů pražských krysaříků.)